A metodologia para o desenvolvimento dos Observatórios foi sistematizada nos “Cadernos de Apoio”, em que foram detalhadas as funções de cada integrante da equipe, bem como as etapas do trabalho e suas principais atividades. A sistematização da metodologia vem permitindo a replicação da experiência em localidades diferentes e já possibilitou que, mesmo à distância, as informações produzidas pelos diversos grupos sejam trocadas pela Rede de Observatórios em tempo real.

A preocupação que orienta nossa metodologia é unir atividades de levantamento de informação com o processo de formação e, considerando as especificidades de cada local, permitir que o processo de trabalho seja participativo e sincronizado entre os diferentes participantes da Rede.